In opdracht van het ministerie van VWS voert ZonMw het programma Kwaliteitsgelden uit. De opdracht omvat het overnemen van het beheer van de kwaliteitsgelden voor de medisch specialistische zorg, ggz, patiënten, huisartsenzorg, verloskunde en met een uitbreiding voor palliatieve zorg. In 2020 zal voor het eerst de financiering van kwaliteitsontwikkeling via ZonMw gaan.
Het doel van dit programma is dat (wetenschappelijke) verenigingen van zorgprofessionals en patiënten kennis en professionele inzichten vertalen in kwaliteitsbeleid en -standaarden voor hun handelen bij specifieke zorgvragen in de praktijk.
Uit onderzoek van de Rekenkamer is gebleken dat de gebruikte route voor het beschikbaar stellen van middelen voor kwaliteitsontwikkeling, onrechtmatig is. Dit is aanleiding geweest voor VWS om te zoeken naar een alternatieve manier om de kwaliteitsgelden te beheren. In 2018 is in overleg met de ontvangers van de kwaliteitsgelden overeengekomen dat ZonMw de kwaliteitsgelden zal gaan beheren via het programma Kwaliteitsgelden.
Het programma Kwaliteitsgelden bestaat uit 3 fases, waarbij de eerste fase in 2020 van start zal gaan. De overige 2 fases zullen later en in overleg met de ontvangende partijen worden ontwikkeld.