Projectomschrijving

Dat erfelijke factoren een belangrijke rol kunnen spelen bij ziekten is al lange tijd duidelijk. Door middel van moderne technieken om het DNA van patiënten op grote schaal uit te lezen en te analyseren is het nu mogelijk om specifieke genetische varianten aan te wijzen die een sleutelrol spelen bij verschillende ziekten. Dit kan dan beter inzicht verschaffen in het onderliggende biologische mechanisme, wat relevant is bijvoorbeeld voor het ontwikkelen van nieuwe geneesmiddelen. In dit Vidi project hebben wij computationele methoden ontwikkeld om een belangrijk regio van het humane genoom, namelijk het HLA, te bestuderen. We hebben deze methoden toegepast op een groot aantal immuun-gerelateerde aandoeningen zoals reumatoïde arthritis en type 1 diabetes. Ons onderzoek bevestigt de rol van specifieke aminozuren in de HLA-eiwitten en de aard van de moleculaire interactie tussen HLA en T-celreceptoren. In een vervolgtraject van dit Vidi project hebben wij de nieuwste sequencing-technieken (waaronder de Oxford Nanopore) gebruikt om nog meer dergelijke complexe regio’s in ons DNA uit te lezen.

Big Data

Wij hebben een methode ontwikkeld om aan de hand van Big Data van genetische studies verzameld in grote aantallen patiënten beter te begrijpen hoe dit precies in elkaar zit. Deze methode maakt slim gebruik van de samenhang tussen dichtbijgelegen varianten in ons DNA, waardoor we precies kunnen zien waar een causaal verband bestaat tussen onze erfelijke genen en het risico op bijvoorbeeld diabetes.

Naar boven
Direct naar: InhoudDirect naar: NavigatieDirect naar: Onderkant website