Projectomschrijving

Tijdens het project “Immune Repertoire in the Picture” is gebruik gemaakt van next generation sequencing (NGS) technologie om de totale set specifieke herkenningsmoleculen van het immuunsysteem (het immuunrepertoire) in kaart te brengen. Hiervoor is een bioinformatische analyse ontwikkeld om de verkregen sequentie data te visualiseren en te kunnen
interpreteren. Met deze nieuwe technologie zijn nieuwe inzichten verkregen in de vorming van een divers immuunrepertoire. Deze nieuwe inzichten zijn verkregen door het bestuderen van patiënten met aangeboren immunologische aandoeningen, zogenaamde primaire immuundeficiënties. Immuunrepertoire analyses worden nu ingezet voor het bestuderen van andere
immunologische aandoeningen. In het kader van een internationale samenwerking hebben wij een nieuwe primaire immuundeficientie beschreven, waarbij het genetische defect invloed heeft op de vorming van het immuunrepertoire. Dit onderzoek heeft de basis gelegd voor een solide onderzoekslijn op het gebied van primaire immuundeficienties met een focus op defecten in de opbouw van het immuunrepertoire en heeft geresulteerd in een groot internationaal network van
samenwerkingspartners.

Analyssetool

In dit project hebben wij een strategie ontwikkeld voor analyse van het naïeve en het antigeen geselecteerde B-cel repertoire. Hiervoor is een analysetool ontwikkeld die vrij toegankelijk is (https://bioinf-galaxian.erasmusmc.nl/argalaxy). Deze nieuwe strategie is ingezet in diverse onderdelen van het project, waarbij patiënten met een genetisch defect in het immuunsysteem
(primaire immuundeficiënties) zijn bestudeerd.

Naar boven
Direct naar: InhoudDirect naar: NavigatieDirect naar: Onderkant website