Improving the TRIcycle protocol: upscaling to national Monitoring, detection of CPE and WGS pipelines for One Health Surveillance
Projectomschrijving
Antimicrobiële resistentie is een “One Health” probleem en omvat mens, dier en het milieu. De WHO heeft een One Health protocol voor de surveillance van ESBL-producerende bacteriën opgesteld (het Tricycle protocol). In TRIuMPH breiden we dit uit naar detectie van carbapenemase producerende Enterobacteriaceae (CPE), bijzonder relevante resistente bacteriën, in mens, dier en het milieu. Deze protocollen passen we samen met het Tricycle protocol toe in Madagaskar, Malaysia en Pakistan. De genetische sequenties van de CPE worden met in het project ontwikkelde openbaar beschikbare tools geanalyseerd. We werken ook aan rioolwatersurveillance door monsters van de polio environmental surveillance op CPE te onderzoeken. Zo krijgen we een beeld van de verspreiding van CPE in landen waar deze bacteriën waarschijnlijk vaak voorkomen, en stellen methoden voor CPE analyses beschikbaar die internationaal toegepast kunnen worden.
Verslagen
Samenvatting van de aanvraag
Antimicrobiële resistentie is een “One Health” probleem en omvat mens, dier en het milieu. De WHO heeft een One Health protocol voor de surveillance van ESBL-producerende bacteriën opgesteld (het Tricycle protocol). In TRIuMPH breiden we dit uit naar detectie van carbapenemase producerende Enterobacteriaceae (CPE), bijzonder relevante resistente bacteriën, in mens, dier en het milieu. Deze protocollen passen we samen met het Tricycle protocol toe in Madagaskar, Malaysia en Pakistan. De genetische sequenties van de CPE worden met in het project ontwikkelde openbaar beschikbare tools geanalyseerd. We werken ook aan rioolwatersurveillance door monsters van de polio environmental surveillance op CPE te onderzoeken. Zo krijgen we een beeld van de verspreiding van CPE in landen waar deze bacteriën waarschijnlijk vaak voorkomen, en stellen methoden voor CPE analyses beschikbaar die internationaal toegepast kunnen worden.