Prevention and Restriction of Antimicrobial Resistance in Pneumococci by Multi-Level Modelling

Projectomschrijving

Streptococcus pneumoniae (de pneumococ) is een veel voorkomende verwekker van infecties bij de mens, in het bijzonder van long ontsteking. Deze bacterie is in toenemende mate resistent tegen thans beschikbare antimicrobiële middelen.

Dit project beoogt meer inzicht te verschaffen in de mechanismen die hieraan ten grondslag liggen, waarbij vooral aandacht zal uitgaan naar omgevings-, immunologische en farmacologische factoren die bepalend zijn voor het ontstaan van antimicrobiële resistentie.

Het project wordt uitgevoerd door een internationaal consortium met uiteenlopende gebieden van expertise dat gebruik zal maken van bestaande patiënten cohorten, verzamelingen van pneumococcen stammen en muis modellen van infectie.

Producten

Titel: Hypoxia-Inducible Factor-1a in Macrophages, but Not in Neutrophils, Is Important for Host Defense during Klebsiella pneumoniae-Induced Pneumosepsis
Auteur: Otto NA, Pereverzeva L, Leopold V, Ramirez-Moral I, Roelofs JJTH, van Heijst JWJ, de Vos AF, van der Poll T
Magazine: Mediators of Inflammation
Titel: Blood leukocyte transcriptomes in gram-positive and gram-negative community-acquired pneumonia
Auteur: Pereverzeva L, Uhel F, Sengers HP, Butler J, van Vught LA, Burnham KL, Davenport EE, Knight JC, Cremer OL, Schultz MJ, Bonten MMJ, Scicluna BP, van der Poll T
Magazine: European Respiratory Journal
Titel: Influence of the causative pathogen on presentation, outcome and host response of severe community-acquired pneumonia
Auteur: Pereverzeva E, Uhel F, Cremer OL, Bonten MJ, Horn J, Schultz MJ, van der Poll T.

Verslagen


Eindverslag

Streptococcus pneumoniae (de pneumokok) is een veel voorkomende verwekker van infecties bij de mens, in het bijzonder van long ontsteking. Deze bacterie is in toenemende mate resistent tegen thans beschikbare antimicrobiële middelen. Dit project beoogt meer inzicht te verschaffen in de mechanismen die hieraan ten grondslag liggen, waarbij vooral aandacht zal uitgaan naar omgevings-, immunologische en farmacologische factoren die bepalend zijn voor het ontstaan van antimicrobiële resistentie. Het project wordt uitgevoerd door een internationaal consortium met uiteenlopende gebieden van expertise dat gebruik zal maken van bestaande patiënten cohorten, verzamelingen van pneumokokken stammen en muis modellen van infectie.

Het deel waarvoor het Amsterdam UMC verantwoordelijk behelsde het bestuderen van de interactie tussen het afweer systeem en pneumokokken, gebruik makend van celkweken (witte bloedcellen, luchtweg epitheel), muismodellen en studies bij patiënten met longontsteking veroorzaakt door pneumokokken.

Streptococcus pneumoniae (de pneumokok) is een veel voorkomende verwekker van infecties bij de mens, in het bijzonder van long ontsteking. Deze bacterie is in toenemende mate resistent tegen thans beschikbare antimicrobiële middelen. Dit project beoogt meer inzicht te verschaffen in de mechanismen die hieraan ten grondslag liggen, waarbij vooral aandacht zal uitgaan naar omgevings-, immunologische en farmacologische factoren die bepalend zijn voor het ontstaan van antimicrobiële resistentie. Het project wordt uitgevoerd door een internationaal consortium met uiteenlopende gebieden van expertise dat gebruik zal maken van bestaande patiënten cohorten, verzamelingen van pneumokokken stammen en muis modellen van infectie.

Het deel waarvoor het Amsterdam UMC verantwoordelijk is behelst het bestuderen van de interactie tussen het afweer systeem en pneumokokken, gebruik makend van celkweken (witte bloedcellen, luchtweg epitheel) en muismodellen.

Samenvatting van de aanvraag

Streptococcus pneumoniae is a major health threat in industrialized and developing countries. The pathogen affects both young and old people, immune-competent as well as immunocompromised individuals. By genetic recombination within diverse populations, individual strains are not only able to evade vaccination but also able to acquire antimicrobial resistance (AMR), which can then be transmitted onwards. This proposal aims to understand the mechanisms and distribution of this pneumococcal AMR repertoire at the genetic, bacterial, host and population levels to layout new strategies for risk assessment, prevention and reduction of AMR. In particular, the environmental, immunological and pharmacological drivers of resistance emergence and selection, the genetic population dynamics, as well as the fitness of the new traits in different host conditions will be analysed and modelled. To this end, a multinational consortium of researchers with complementary expertise has been formed. Available to the consortium are clinically important and newly emerged pneumococcal AMR strains, together with related patient metadata (clinical, genetic and transcriptomic) from clinical cohorts as well as highly detailed carriage sampling from a Thai cohort. Consortium members have proven expertise in microbiology, bacterial genetics, bioinformatics, in vivo/in vitro models while others are clinicians expert in the treatment of pneumococcal infections in both paediatric and adult patients. In a concerted effort, this consortium will develop countermeasures against antimicrobial resistance in a major health threat by multi-level modelling of its resistance emergence, selection, and transmission in diverse environments.

Onderwerpen

Kenmerken

Projectnummer:
547001008
Looptijd: 100%
2017
2021
Onderdeel van programma:
Gerelateerde subsidieronde:
3rd JTC Transmission Dynamics
Projectleider en penvoerder:
Prof. dr. T. van der Poll
Verantwoordelijke organisatie:
Amsterdam UMC - locatie AMC